Пакет: sibsim4 (0.20-1)

[ Источник: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::TODO, use::comparing, Поиск, Поддерживаемые форматы: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к sibsim4

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

Загрузка sibsim4

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	34,0 Кб	108,0 Кб	[список файлов]
armel	34,0 Кб	104,0 Кб	[список файлов]
armhf	30,2 Кб	79,0 Кб	[список файлов]
i386	32,1 Кб	96,0 Кб	[список файлов]
ia64	49,6 Кб	156,0 Кб	[список файлов]
kfreebsd-amd64	34,0 Кб	82,0 Кб	[список файлов]
kfreebsd-i386	32,0 Кб	74,0 Кб	[список файлов]
mips	35,2 Кб	116,0 Кб	[список файлов]
mipsel	35,5 Кб	112,0 Кб	[список файлов]
powerpc	34,5 Кб	108,0 Кб	[список файлов]
s390	34,6 Кб	108,0 Кб	[список файлов]
s390x	37,0 Кб	104,0 Кб	[список файлов]
sparc	32,2 Кб	104,0 Кб	[список файлов]