Пакет: concavity (0.1+dfsg.1-5)

[ Источник: concavity  ]

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Другие пакеты, относящиеся к concavity

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• sug: conservation-code

  protein sequence conservation scoring tool

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

Загрузка concavity

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	238,5 Кб	973,0 Кб	[список файлов]
arm64	224,0 Кб	941,0 Кб	[список файлов]
armel	224,9 Кб	933,0 Кб	[список файлов]
armhf	222,9 Кб	809,0 Кб	[список файлов]
i386	252,5 Кб	1 020,0 Кб	[список файлов]
mips64el	252,7 Кб	1 168,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	252,8 Кб	1 130,0 Кб	[список файлов]
s390x	224,1 Кб	969,0 Кб	[список файлов]