[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Источник: openbabel  ]

Пакет: openbabel (2.2.3-1 и другие)

Chemical toolbox utilities

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include: 

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities: 

 * babel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode

Теги: Область: Химия, Реализовано на: C++, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Преобразование данных

Другие пакеты, относящиеся к openbabel

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips, mipsel]
    dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [не armel, hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [не armel]
    Стандартная библиотека GNU C++ версии 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    библиотека для определения цепочек вызовов программ - основные компоненты
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    библиотека сжатия

Загрузка openbabel

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 2.2.3-1 122,7 Кб480 Кб [список файлов]
armel 2.2.3-1+b1 111,5 Кб420 Кб [список файлов]
hppa 2.2.3-1 124,1 Кб444 Кб [список файлов]
i386 2.2.3-1 118,1 Кб428 Кб [список файлов]
ia64 2.2.3-1+b1 146,3 Кб604 Кб [список файлов]
mips 2.2.3-1 117,5 Кб464 Кб [список файлов]
mipsel 2.2.3-1 117,1 Кб464 Кб [список файлов]
powerpc 2.2.3-1 138,1 Кб508 Кб [список файлов]
s390 2.2.3-1 119,0 Кб432 Кб [список файлов]
sparc 2.2.3-1 118,8 Кб428 Кб [список файлов]