Пакет: molphy (2.3b3-5) [non-free]

[ Источник: molphy  ]

Program Package for MOLecular PHYlogenetics

ProtML is a main program in MOLPHY for inferring evolutionary trees from PROTein (amino acid) sequences by using the Maximum Likelihood method. Other programs (C language)

 NucML:  Maximum Likelihood Inference of Nucleic Acid Phylogeny
 ProtST: Basic Statistics of Protein Sequences
 NucST:  Basic Statistics of Nucleic Acid Sequences
 NJdist: Neighbor Joining Phylogeny from Distance Matrix

Utilities (Perl)

 mollist:  get identifiers list        molrev:   reverse DNA sequences
 molcat:   concatenate sequences       molcut:   get partial sequences
 molmerge: merge sequences             nuc2ptn:  DNA -> Amino acid
 rminsdel: remove INS/DEL sites        molcodon: get specified codon sites
 molinfo:  get varied sites            mol2mol:  MOLPHY format beautifer
 inl2mol:  Interleaved -> MOLPHY       mol2inl:  MOLPHY -> Interleaved
 mol2phy:  MOLPHY -> Sequential        phy2mol:  Sequential -> MOLPHY
 must2mol: MUST -> MOLPHY              etc.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Анализ, Сравнение

Другие пакеты, относящиеся к molphy

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [не ia64]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [ia64]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: perl

  интерпретатор для сценариев на языке Perl

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

Загрузка molphy

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	276,1 Кб	876,0 Кб	[список файлов]
armel	307,2 Кб	912,0 Кб	[список файлов]
i386	236,0 Кб	816,0 Кб	[список файлов]
ia64	410,4 Кб	1 432,0 Кб	[список файлов]
mips	310,4 Кб	1 024,0 Кб	[список файлов]
mipsel	311,2 Кб	984,0 Кб	[список файлов]
powerpc	299,7 Кб	908,0 Кб	[список файлов]
s390	268,2 Кб	856,0 Кб	[список файлов]
sparc	268,5 Кб	840,0 Кб	[список файлов]