[  lenny  ] [  sid  ]
[ Исходник: proda  ]

Пакет: proda (1.0-7)

multiple alignment of protein sequences

ProDA is a system for automated detection and alignment of homologous regions in collections of proteins with arbitrary domain architectures. Given an input set of unaligned sequences, ProDA identifies all homologous regions appearing in one or more sequences, and returns a collection of local multiple alignments for these regions.

ProDA is published in: Phuong T.M., Do C.B., Edgar R.C., and Batzoglou S. Multiple alignment of protein sequences with repeats and rearrangements. Nucleic Acids Research 2006 34(20), 5932-5942.

Теги: Биология: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Протеины, Область: Биология, Реализовано на: C++, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Анализ, Сравнение, Поддерживаемые форматы: Plain Text

Другие пакеты, относящиеся к proda

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [не arm, armel, hppa, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    вспомогательная библиотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
    вспомогательная библиотека GCC
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [не armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Стандартная библиотека GNU C++ версии 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    библиотека для определения цепочек вызовов программ - основные компоненты

Загрузка proda

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha 73,1 Кб232 Кб [список файлов]
amd64 66,6 Кб196 Кб [список файлов]
arm 70,0 Кб196 Кб [список файлов]
armel 64,5 Кб184 Кб [список файлов]
hppa 73,1 Кб208 Кб [список файлов]
i386 62,0 Кб144 Кб [список файлов]
ia64 99,3 Кб376 Кб [список файлов]
kfreebsd-amd64 (неофициальный перенос) 66,6 Кб168 Кб [список файлов]
kfreebsd-i386 (неофициальный перенос) 62,8 Кб158 Кб [список файлов]
m68k 54,8 Кб184 Кб [список файлов]
mips 70,0 Кб248 Кб [список файлов]
mipsel 70,2 Кб248 Кб [список файлов]
powerpc 71,3 Кб208 Кб [список файлов]
s390 62,4 Кб188 Кб [список файлов]
sparc 63,2 Кб192 Кб [список файлов]