[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Исходник: poa  ]

Пакет: poa (2.0+20060928-2)

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW. POA is published in Bioinformatics. 2004 Jul 10;20(10):1546-56.

Теги: Область: Биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Поддерживаемые форматы: Plain Text

Другие пакеты, относящиеся к poa

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • sug: blast2
    утилита поиска первичных биологических последовательностей

Загрузка poa

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha 51,2 Кб228 Кб [список файлов]
amd64 49,0 Кб196 Кб [список файлов]
arm 49,5 Кб208 Кб [список файлов]
armel 52,1 Кб204 Кб [список файлов]
hppa 48,0 Кб212 Кб [список файлов]
hurd-i386 44,1 Кб180 Кб [список файлов]
i386 44,1 Кб184 Кб [список файлов]
ia64 69,8 Кб368 Кб [список файлов]
kfreebsd-amd64 (неофициальный перенос) 49,0 Кб154 Кб [список файлов]
kfreebsd-i386 (неофициальный перенос) 44,0 Кб138 Кб [список файлов]
m68k 40,6 Кб176 Кб [список файлов]
mips 48,0 Кб252 Кб [список файлов]
mipsel 49,2 Кб260 Кб [список файлов]
powerpc 46,5 Кб208 Кб [список файлов]
s390 51,8 Кб208 Кб [список файлов]
sparc 45,7 Кб216 Кб [список файлов]