etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Источник: perlprimer  ]

Пакет: perlprimer (1.1.18-1)

Graphical design of primers for PCR

PerlPrimer is a free, open-source GUI application written in Perl that designs primers for standard Polymerase Chain Reaction (PCR), bisulphite PCR, real-time PCR (QPCR) and sequencing. It aims to automate and simplify the process of primer design.

If operated online, the tool nicely communicates with the Ensembl project for further insights into the gene structure, i.e., allowing for taking the location of exons and introns into account for the design of the primers. The sequences themselves can be retrieved, too.

Теги: Биология: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Нуклеиновые кислоты, Протеины, Область: Биология, Молекулярная биология, Реализовано на: Perl, Пользовательский интерфейс: X Window System, Сеть: Клиент, Роль: Программа, Область: Утилита, Инструментарий интерфейса: Tk, Цель: Анализ, Поддерживаемые форматы: Простой текст, X Window System: Приложение

Другие пакеты, относящиеся к perlprimer

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libwww-perl
    Perl HTTP/WWW client/server library
  • dep: perl-tk
    Perl module providing the Tk graphics library
  • rec: ncbi-tools-bin
    NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)

Загрузка perlprimer

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 112,7 Кб544 Кб [список файлов]