[  lenny  ] [  sid  ]
[ Исходник: melting  ]

Пакет: melting (4.2h-3)

computing the melting temperature of nucleic acid duplex

This program computes, for a nucleic acid duplex, the enthalpy, the entropy and the melting temperature of the helix-coil transitions. Three types of hybridisation are possible: DNA/DNA, DNA/RNA, and RNA/RNA. The program first computes the hybridisation enthalpy and entropy from the elementary parameters of each Crick's pair by the nearest-neighbor method. Then the melting temperature is computed. The set of thermodynamic parameters can be easily changed, for instance following an experimental breakthrough. Melting was published in Le Novère N. (2001), Bioinformatics, 17: 1226-1227.

Теги: Биология: Nucleic Acids, Область: Molecular Biology, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Анализ, Поддерживаемые форматы: Plain Text

Другие пакеты, относящиеся к melting

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • sug: melting-gui
    Graphical user interface for melting

Загрузка melting

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha 211,3 Кб604 Кб [список файлов]
amd64 210,8 Кб596 Кб [список файлов]
arm 206,4 Кб592 Кб [список файлов]
armel 211,5 Кб596 Кб [список файлов]
hppa 210,8 Кб596 Кб [список файлов]
hurd-i386 206,3 Кб592 Кб [список файлов]
i386 209,3 Кб596 Кб [список файлов]
ia64 212,4 Кб632 Кб [список файлов]
kfreebsd-amd64 (неофициальный перенос) 207,3 Кб436 Кб [список файлов]
kfreebsd-i386 (неофициальный перенос) 206,2 Кб432 Кб [список файлов]
m68k 204,6 Кб592 Кб [список файлов]
mips 210,6 Кб600 Кб [список файлов]
mipsel 207,1 Кб600 Кб [список файлов]
powerpc 207,4 Кб596 Кб [список файлов]
s390 206,9 Кб596 Кб [список файлов]
sparc 206,8 Кб596 Кб [список файлов]