[  sarge  ] [  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Исходник: clustalx  ]

Пакет: clustalx (1.83-4 и другие) [non-free]

GUI for Clustal W

This package offers a GUI interface for the Clustal W multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

Теги: Биология: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nucleic Acids, Протеины, Область: Биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: X Window System, Роль: Программа, Область: Утилита, Инструментарий интерфейса: Lesstif/Motif, Цель: Анализ, Сравнение, Визуализация данных, Поддерживаемые форматы: Plain Text, X Window System: Приложение

Другие пакеты, относящиеся к clustalx

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: clustalw [m68k]
    global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
  • dep: lesstif1 [m68k]
    Пакет недоступен
  • dep: lesstif2 [не m68k]
    OSF/Motif 2.1 implementation released under LGPL
  • dep: libc6 (>= 2.3.1-1) [m68k]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, ia64, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • dep: libncbi6 (>= 6.1.20030421)
    NCBI libraries for biology applications
  • dep: libvibrant6 (>= 6.1.20030421) [m68k]
    Пакет недоступен
  • dep: libvibrant6a (>= 6.1.20060507) [не m68k]
    NCBI libraries for graphic biology applications
  • dep: libx11-6 [не m68k]
    библиотека X11 для клиентской стороны
  • dep: libxmu6 [не m68k]
    X11 miscellaneous utility library
  • dep: libxt6 [не m68k]
    библиотека инструментальных средств разработки X11
  • dep: xlibs (>> 4.1.0) [m68k]
    Пакет недоступен
  • sug: boxshade
    Pretty-printing of multiple sequence alignments
  • sug: texshade
    Пакет недоступен
    или texlive-latex-extra
    TeX Live: LaTeX supplementary packages

Загрузка clustalx

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha 1.83-4 271,5 Кб812 Кб [список файлов]
amd64 1.83-4 242,9 Кб700 Кб [список файлов]
arm 1.83-4 235,4 Кб684 Кб [список файлов]
hppa 1.83-4 248,8 Кб708 Кб [список файлов]
i386 1.83-4 223,5 Кб684 Кб [список файлов]
ia64 1.83-4 324,3 Кб1076 Кб [список файлов]
m68k 1.83-1 196,1 Кб600 Кб [список файлов]
mips 1.83-4 253,9 Кб808 Кб [список файлов]
mipsel 1.83-4 258,8 Кб824 Кб [список файлов]
powerpc 1.83-4 246,4 Кб720 Кб [список файлов]
s390 1.83-4 238,3 Кб704 Кб [список файлов]
sparc 1.83-4 231,2 Кб688 Кб [список файлов]