Пакет: autodock (4.2.3-2 и другие)

[ Источник: autodocksuite  ]

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Теги: Область: Биология, Структурная биология, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, works-with-format::TODO, Работает с: 3D-модель, Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к autodock

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.1-udeb

• dep: libc0.3 (>= 2.2.6) [hurd-i386]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc0.3-udeb

• dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.10) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.13) [s390x, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.2) [mips, mipsel, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, powerpcspe, s390]

  dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]

  dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]

  библиотека Embedded GNU C (динамические библиотеки)
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc1 [powerpcspe]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [не armel, armhf, avr32, hppa, hurd-i386, m68k, powerpcspe]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [avr32]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

  dep: libgcc1 (>= 4.2.1) [hurd-i386]

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 [powerpcspe]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [не armel, armhf, avr32, powerpcspe]

  dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [avr32]

  dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel, armhf]

• dep: libunwind7 [ia64]

  библиотека для определения цепочек вызовов программ - основные компоненты

• sug: autodocktools

  GUI to help set up, launch and analyze AutoDock dockings

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Загрузка autodock

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	4.2.3-2	214,4 Кб	544,0 Кб	[список файлов]
amd64	4.2.3-2	182,0 Кб	464,0 Кб	[список файлов]
armel	4.2.3-2	183,3 Кб	436,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.2.3-2	164,5 Кб	324,0 Кб	[список файлов]
avr32 (неофициальный перенос)	4.2.3-1	183,2 Кб	404,0 Кб	[список файлов]
hppa	4.2.3-1	206,7 Кб	484,0 Кб	[список файлов]
hurd-i386	4.2.3-2+b1	165,5 Кб	420,0 Кб	[список файлов]
i386	4.2.3-2	164,6 Кб	448,0 Кб	[список файлов]
ia64	4.2.3-2	283,0 Кб	960,0 Кб	[список файлов]
kfreebsd-amd64	4.2.3-2	182,1 Кб	458,0 Кб	[список файлов]
kfreebsd-i386	4.2.3-2	165,3 Кб	442,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	4.2.1+rc1-2	133,4 Кб	388,0 Кб	[список файлов]
mips	4.2.3-2	185,0 Кб	476,0 Кб	[список файлов]
mipsel	4.2.3-2	186,3 Кб	476,0 Кб	[список файлов]
powerpc	4.2.3-2	186,0 Кб	436,0 Кб	[список файлов]
powerpcspe (неофициальный перенос)	4.2.3-2	205,7 Кб	488,0 Кб	[список файлов]
s390	4.2.3-2	171,0 Кб	424,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.2.3-2	181,7 Кб	438,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	4.2.3-2	206,0 Кб	448,0 Кб	[список файлов]
sparc	4.2.3-2	189,5 Кб	456,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	4.2.3-2	196,2 Кб	488,0 Кб	[список файлов]