[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Источник: openbabel  ]

Пакет: openbabel (2.2.0-2)

Chemical toolbox utilities

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include: 

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities: 

 * babel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode

Теги: Область: Химия, Реализовано на: C++, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Преобразование данных

Другие пакеты, относящиеся к openbabel

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [не arm, armel, hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [не armel]
    Стандартная библиотека GNU C++ версии 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    библиотека для определения цепочек вызовов программ - основные компоненты
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    библиотека сжатия

Загрузка openbabel

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha 222,4 Кб596 Кб [список файлов]
amd64 222,3 Кб580 Кб [список файлов]
arm 219,9 Кб524 Кб [список файлов]
armel 210,6 Кб516 Кб [список файлов]
hppa 224,5 Кб540 Кб [список файлов]
i386 217,4 Кб528 Кб [список файлов]
ia64 246,0 Кб704 Кб [список файлов]
mips 214,5 Кб560 Кб [список файлов]
mipsel 217,4 Кб560 Кб [список файлов]
powerpc 242,6 Кб616 Кб [список файлов]
s390 218,8 Кб528 Кб [список файлов]
sparc 217,7 Кб528 Кб [список файлов]