[  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Источник: autodocksuite  ]

Пакет: autodock (4.0.1-3)

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Теги: Область: Биология, Структурная биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Анализ, Работает с: 3D-модель

Другие пакеты, относящиеся к autodock

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [не arm, armel, hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    вспомогательная библиотека GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [не armel]
    Стандартная библиотека GNU C++ версии 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    библиотека для определения цепочек вызовов программ - основные компоненты
  • rec: autogrid
    pre-calculate binding of ligands to their receptor

Загрузка autodock

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha 1 494,0 Кб1884 Кб [список файлов]
amd64 1 468,0 Кб1820 Кб [список файлов]
arm 1 479,0 Кб1816 Кб [список файлов]
armel 1 475,5 Кб1812 Кб [список файлов]
hppa 1 496,3 Кб1848 Кб [список файлов]
i386 1 449,7 Кб1733 Кб [список файлов]
ia64 1 570,5 Кб2228 Кб [список файлов]
mips 1 501,0 Кб1952 Кб [список файлов]
mipsel 1 499,5 Кб1964 Кб [список файлов]
powerpc 1 476,0 Кб1820 Кб [список файлов]
s390 1 460,7 Кб1792 Кб [список файлов]
sparc 1 470,4 Кб1832 Кб [список файлов]