Пакет: autodock (4.0.1-3)

[ Источник: autodocksuite  ]

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Теги: Область: Биология, Структурная биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Анализ, Работает с: 3D-модель

Другие пакеты, относящиеся к autodock

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [не alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [не arm, armel, hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [не armel]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]

• dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]

  библиотека для определения цепочек вызовов программ - основные компоненты

• rec: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Загрузка autodock

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha	1 494,0 Кб	1 884,0 Кб	[список файлов]
amd64	1 468,0 Кб	1 820,0 Кб	[список файлов]
arm	1 479,0 Кб	1 816,0 Кб	[список файлов]
armel	1 475,5 Кб	1 812,0 Кб	[список файлов]
hppa	1 496,3 Кб	1 848,0 Кб	[список файлов]
i386	1 449,7 Кб	1 733,0 Кб	[список файлов]
ia64	1 570,5 Кб	2 228,0 Кб	[список файлов]
mips	1 501,0 Кб	1 952,0 Кб	[список файлов]
mipsel	1 499,5 Кб	1 964,0 Кб	[список файлов]
powerpc	1 476,0 Кб	1 820,0 Кб	[список файлов]
s390	1 460,7 Кб	1 792,0 Кб	[список файлов]
sparc	1 470,4 Кб	1 832,0 Кб	[список файлов]