Пакет: plink1.9 (1.90~b6.26-220402-1)

[ Источник: plink1.9  ]

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink1.9 is a comprehensive update of plink with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

Please note: The executable was renamed to plink1.9 because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/plink1.9/README.Debian.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к plink1.9

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.33)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  библиотека сжатия

Загрузка plink1.9

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	870,3 Кб	2 112,0 Кб	[список файлов]
armel	780,4 Кб	2 067,0 Кб	[список файлов]
armhf	766,3 Кб	1 491,0 Кб	[список файлов]
i386	877,0 Кб	2 355,0 Кб	[список файлов]
mipsel	847,4 Кб	2 365,0 Кб	[список файлов]