Package: embassy-domainatrix (0.1.0+20110714-1)

[ Source: embassy-domainatrix  ]

Comandos EMBOSS extra para tratar ficheiros de classificação de domínios

Os programas DOMAINATRIX foram desenvolvidos por Jon Ison e colegas do MRC HGMP para a sua pesquisa em domínios de proteínas. Estão incluídos no pacote EMBASSY como trabalho em progresso.

Aplicações no lançamento corrente do domainatrix são cathparse (gera ficheiros DCF a partir de ficheiros CATH), domainnr (remove domínios redundantes de um ficheiro DCF), domainreso (remove domínios de baixa resolução de ficheiros DCF), domainseqs (acrescenta registos de sequência a um ficheiro DCF), domainsse (acrescenta registos de estrutura secundária a um ficheiro DCF), scopparse (gera um ficheiro DCF a partir de ficheiros SCOP) e ssematch (pesquisa um ficheiro DCF à procura de estruturas secundárias).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Application Suite: suite::TODO, use::analysing, Purpose: Data Conversion, Editing, use::searching, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

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