Package: tree-puzzle (5.2-5)

[ Source: tree-puzzle  ]

Reconstrução de árvores filogenéticas por máxima parecença

TREE-PUZZLE (o novo nome para PUZZLE) é um programa de consola interactivo que implementa um algoritmo rápido de pesquisa de árvore, intrigante em quarteto, que permite a análise de grandes conjuntos de dados e atribui automaticamente estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE também computa distâncias pareadas de máxima parecença assim como o alcance de ramificações para árvores especificadas pelo utilizador. O alcance das ramificações também pode ser calculado sub a assumpção de relógio. Adicionalmente, TREE-PUZZLE oferece um método inovador de mapeamento de parecenças, para investigar o suporte de um ramo interno hipotético sem computar uma árvore inteira e para visualizar o conteúdo filogenético de uma sequência de alinhamento.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

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• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Biblioteca C GNU Embebida: Bibliotecas partilhadas
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• dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

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  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

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  The SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

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  Reconstrução de árvores filogenéticas por máxima parecença

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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armel	153.0 kB	368.0 kB	[list of files]
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ia64	212.0 kB	668.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	142.6 kB	322.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	125.5 kB	306.0 kB	[list of files]
mips	163.2 kB	444.0 kB	[list of files]
mipsel	162.6 kB	444.0 kB	[list of files]
powerpc	151.3 kB	364.0 kB	[list of files]
s390	139.9 kB	336.0 kB	[list of files]
sparc	137.6 kB	340.0 kB	[list of files]