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[ Source: proda  ]

Package: proda (1.0-7)

Alinhamento múltiplo para sequencias de proteínas

ProDA é um sistema para detecção automática e alinhamento de regiões homólogas em colecções de proteínas com arquitecturas de domínio arbitrárias. Dada uma entrada de um conjunto de sequências não alinhadas, o ProDA identifica todas as regiões homólogas qua aparecem em uma ou mais sequências, e retorna uma colecção de alinhamentos múltiplos locais para essas regiões.

O ProDA está publicado em: Phuong T.M., Do C.B., Edgar R.C., and Batzoglou S. Multiple alignment of protein sequences with repeats and rearrangements. Nucleic Acids Research 2006 34(20), 5932-5942.

Tags: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

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Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 73.1 kB232 kB [list of files]
amd64 66.6 kB196 kB [list of files]
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