Package: proda (1.0-7)

[ Source: proda  ]

alinhamento múltiplo de seqüências de proteína

ProDA é um sistema para detecção automática e alinhamento de regiões homólogas em coleções de proteína com arquiteturas de domínio arbitrário. Dado um conjunto de entrada de seqüências desalinhadas, o ProDA identifica todas as regiões homólogas que aparecem em uma ou mais seqüências, e retorna uma coleção de múltiplos alinhamentos locais para estas regiões.

O ProDA é publicado em: Phuong T.M., Do C.B., Edgar R.C., e Batzoglou S. Multiple alignment of protein sequences with repeats and rearrangements. Nucleic Acids Research 2006 34(20), 5932-5942.

Tags: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

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