Package: blast2 (1:2.2.21.20090809-2)

[ Source: ncbi-tools6  ]

Basic Local Alignment Search Tool ("Fer. Básica de Busca de Alinhamento Local")

O famoso programa de alinhamento de seqüência. Esta é a versão "oficial" NCBI, #2. O executável blastall possibilita a você entrar uma seqüência de nucleotídeos ou proteína ao programa. Ela é comparada com bancos de dados e um sumário de acertos é retornado ao usuário.

Note que bancos de dados não estão incluídos no Debian; eles precisam ser recuperados manualmente.

Tags: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Science: Calculation, Scope: Utility, Purpose: Searching, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to blast2

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  biblioteca GNU C embarcada: bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.7) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  biblioteca GNU C embarcada: bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  biblioteca GNU C embarcada: bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libncbi6 (<< 6.1.20090809.1)

  Bibliotecas NCBI para aplicações em biologia.

  dep: libncbi6 (>= 6.1.20090809)

• sug: libvibrant6a

  NCBI libraries for graphic biology applications

• sug: ncbi-rrna-data

  large rRNA BLAST databases distributed with the NCBI toolkit

• sug: ncbi-tools-bin

  bibliotecas NCBI para aplicações de biologia (utilitários baseadas em texto)

• sug: ncbi-tools-x11

  bibliotecas NCBI para aplicações de biologia (utilitários baseados em X)

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Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	649.2 kB	1,376.0 kB	[list of files]
armel	654.8 kB	1,300.0 kB	[list of files]
i386	624.8 kB	1,260.0 kB	[list of files]
ia64	724.6 kB	2,032.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	640.7 kB	1,268.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	620.2 kB	1,174.0 kB	[list of files]
mips	629.5 kB	1,340.0 kB	[list of files]
mipsel	636.5 kB	1,340.0 kB	[list of files]
powerpc	640.4 kB	1,308.0 kB	[list of files]
s390	655.1 kB	1,324.0 kB	[list of files]
sparc	634.3 kB	1,276.0 kB	[list of files]