Package: autodock (4.2.3-1)

[ Source: autodocksuite  ]

análise das ligações do ligante à estrutura de proteína

AutoDock é um representante único dos programas que tratam a simulação da atracagem indo de ligantes químicos bem pequenos até receptores grandes de proteínas. Versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto a proteína era mantida rígida. Esta última versão 4 também permite flexibilidade de cadeias laterais selecionadas dos resíduos de superfície, i.e., leva os "rotamers" em consideração.

O programa AutoDock realiza a atracagem do ligante a um conjunto de grades descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grades.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Works with: 3D Model

Other Packages Related to autodock

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  biblioteca GNU C embarcada: bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

  biblioteca GNU C embarcada: bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.2) [mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]

  biblioteca GNU C embarcada: bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [not armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [not armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  A biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 4.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel]

• dep: libunwind7 [ia64]

  uma biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - tempo de execução

• sug: autodocktools

  Package not available

• sug: autogrid

  pré-calcula ligações de ligantes aos seus receptores

Download autodock

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	178.7 kB	460.0 kB	[list of files]
armel	185.0 kB	448.0 kB	[list of files]
i386	161.4 kB	440.0 kB	[list of files]
ia64	279.3 kB	976.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	178.7 kB	442.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	161.6 kB	426.0 kB	[list of files]
mips	205.7 kB	560.0 kB	[list of files]
mipsel	207.4 kB	560.0 kB	[list of files]
powerpc	188.1 kB	448.0 kB	[list of files]
s390	170.8 kB	420.0 kB	[list of files]
sparc	198.0 kB	496.0 kB	[list of files]