[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: tree-puzzle  ]

Package: tree-ppuzzle (5.2-5)

reconstrução paralelizada de árvores filogenéticas por máxima probabilidade

TREE-PUZZLE (o novo nome para o PUZZLE) é um programa interativo para console que implementa um algoritmo de procura rápida em árvore, "quartet puzzling", que permite análise de grandes conjuntos de dados e automaticamente atribui estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE oferece um método novo, com mapeamento por estimativa, para investigar o suporte a um ramo interno hipotético sem computar uma árvore completa e visualizar o conteúdo filogenético de um alinhamento de seqüência.

Esta é a versão paralelizada do tree-puzzle.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

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  • dep: lam-runtime
    LAM runtime environment for executing parallel programs
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
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    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, mips, mipsel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5) [hppa]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: liblam4
    Shared libraries used by LAM parallel programs
  • dep: libsprng2
    The SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package
  • rec: tree-puzzle-doc
    Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood
  • sug: phylip
    [Biology] A package of programs for inferring phylogenies
  • sug: treetool
    interactive tool for displaying phylogenetic trees

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Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 175.9 kB444 kB [list of files]
amd64 158.9 kB372 kB [list of files]
armel 169.3 kB400 kB [list of files]
hppa 172.4 kB396 kB [list of files]
i386 139.1 kB352 kB [list of files]
ia64 239.5 kB740 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 159.3 kB354 kB [list of files]
kfreebsd-i386 139.4 kB338 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 126.9 kB352 kB [list of files]
mips 181.8 kB484 kB [list of files]
mipsel 180.9 kB484 kB [list of files]
powerpc 168.7 kB396 kB [list of files]
s390 157.0 kB372 kB [list of files]
sparc 152.5 kB368 kB [list of files]