Package: hmmer (2.3.2-5 and others)

Links for hmmer

Debian Resources:

Download Source Package hmmer:

Maintainers:

Debian-Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Matthew Vernon (QA Page)
Nelson A. de Oliveira (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)

External Resources:

Homepage [hmmer.janelia.org]

Similar packages:

perfis "hidden Markov models" para análise de seqüência de proteína

HMMER é uma implementação do métodos de perfil "hidden Markov model" (modelo Markov oculto) para buscas sensíveis de bases de dados de seqüências biológicas usando múltiplas seqüências de alinhamento como consultas.

Dada uma múltipla seqüência de alinhamento como entrada, HMMER constrói um modelo estatístico chamado "hidden Markov model" (modelo Markov oculto) que pode então ser usado como uma consulta em um banco de dados de seqüências para encontrar (e/ou alinhar) homólogos adicionais da família da seqüência.

Tags: Biology: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Proteins, Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching, Works with: Databases, Supports Format: Plain Text

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dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libpvm3 [not hurd-i386]

Parallel Virtual Machine - shared libraries

rec: biosquid

utilitários para análise de seqüência biológica

sug: hmmer-doc (>= 2.3.2-5)

profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)
sug: hmmer-pvm (>= 2.3.2-5)

HMMER programs with PVM (Parallel Virtual Machine) support

Download hmmer

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha	2.3.2-5	1,345.2 kB	3080 kB	[list of files]
amd64	2.3.2-5	1,191.2 kB	2512 kB	[list of files]
arm	2.3.2-5	1,052.8 kB	2015 kB	[list of files]
armel	2.3.2-5	1,120.2 kB	2280 kB	[list of files]
hppa	2.3.2-5	1,216.0 kB	2344 kB	[list of files]
hurd-i386	2.1.4	1,589.9 kB	6872 kB	[list of files]
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