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[ Source: gromacs  ]

Package: gromacs (4.0.5-4 and others)

simulador de dinâmica molecular, com ferramentas de construção e análise

GROMACS é um pacote versátil para realizar dinâmica molecular, i.e. simular equações Newtonianas de movimento para sistemas indo de centenas a milhões de partículas.

Ele é primariamente projetado para moléculas bioquímicas como proteínas e lipídios que têm várias interações de ligações químicas complicadas, mas como o GROMACS é extremamente rápido em calcular interações sem ligações químicas (que usualmente dominam as simulações) vários grupos também estão usando-o para pesquisa em sistemas não-biológicos, e.g. polímeros.

GROMACS oferece por completo recursos demais para uma breve descrição de forma justa. Uma listagem mais completa está disponível em <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

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  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    X11 Inter-Client Exchange library
  • dep: libsm6
    X11 Session Management library
  • dep: libx11-6
    biblioteca para o cliente X11
  • rec: cpp
    o GNU C preprocessor (cpp -- GNU pré-processador C)

Download gromacs

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 4.0.5-4 4,599.9 kB16480 kB [list of files]
amd64 4.0.5-4 4,379.3 kB15608 kB [list of files]
armel 4.0.5-4 4,775.8 kB17096 kB [list of files]
hppa 4.0.5-4 4,311.2 kB17676 kB [list of files]
i386 4.0.5-4 3,731.5 kB12556 kB [list of files]
ia64 4.0.5-4 6,250.3 kB35332 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 4.0.5-4 4,378.6 kB15544 kB [list of files]
kfreebsd-i386 4.0.5-4 3,727.1 kB12640 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 4.0.4-1 3,808.6 kB12524 kB [list of files]
mips 4.0.5-4 4,204.3 kB20460 kB [list of files]
mipsel 4.0.5-4 4,166.1 kB20460 kB [list of files]
powerpc 4.0.5-4 4,391.7 kB18336 kB [list of files]
s390 4.0.5-4 4,337.4 kB14540 kB [list of files]
sparc 4.0.5-4 4,027.2 kB16292 kB [list of files]