[  sarge  ] [  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: ncbi-tools6  ]

Package: blast2 (1:2.2.18.20080302-3 and others)

Basic Local Alignment Search Tool ("Fer. Básica de Busca de Alinhamento Local")

O famoso programa de alinhamento de seqüência. Esta é a versão "oficial" NCBI, #2. O executável blastall possibilita a você entrar uma seqüência de nucleotídeos ou proteína ao programa. Ela é comparada com bancos de dados e um sumário de acertos é retornado ao usuário.

Note que bancos de dados não estão incluídos no Debian; eles precisam ser recuperados manualmente.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching

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  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
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  • dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [armel]
    Biblioteca de suporte GCC
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    Bibliotecas NCBI para aplicações em biologia.
    dep: libncbi6 (>= 6.1.20080302)
  • sug: libvibrant6a
    NCBI libraries for graphic biology applications
  • sug: ncbi-tools-bin
    bibliotecas NCBI para aplicações de biologia (utilitários baseadas em texto)
  • sug: ncbi-tools-x11
    bibliotecas NCBI para aplicações de biologia (utilitários baseados em X)

Download blast2

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 1:2.2.18.20080302-3 666.6 kB1460 kB [list of files]
amd64 1:2.2.18.20080302-3 650.7 kB1293 kB [list of files]
arm 1:2.2.18.20080302-3 625.0 kB1224 kB [list of files]
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hppa 1:2.2.18.20080302-3 641.6 kB1268 kB [list of files]
i386 1:2.2.18.20080302-3 622.4 kB1192 kB [list of files]
ia64 1:2.2.18.20080302-3 726.3 kB1696 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 1:2.2.18.20080302-3 643.1 kB1264 kB [list of files]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 1:2.2.18.20080302-3 619.9 kB1154 kB [list of files]
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mips 1:2.2.18.20080302-3 634.9 kB1336 kB [list of files]
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powerpc 1:2.2.18.20080302-3 685.4 kB1400 kB [list of files]
s390 1:2.2.18.20080302-3 655.1 kB1312 kB [list of files]
sparc 1:2.2.18.20080302-3 632.7 kB1268 kB [list of files]