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[ Source: autodocksuite  ]

Package: autodock (4.0.1-3)

análise das ligações do ligante à estrutura de proteína

AutoDock é um representante único dos programas que tratam a simulação da atracagem indo de ligantes químicos bem pequenos até receptores grandes de proteínas. Versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto a proteína era mantida rígida. Esta última versão 4 também permite flexibilidade de cadeias laterais selecionadas dos resíduos de superfície, i.e., leva os "rotamers" em consideração.

O programa AutoDock realiza a atracagem do ligante a um conjunto de grades descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grades.

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  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    Biblioteca de suporte GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    Biblioteca de suporte GCC
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    Biblioteca de suporte GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [not armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    A biblioteca C++ padrão da GNU v3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    uma biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - tempo de execução
  • rec: autogrid
    pré-calcula ligações de ligantes aos seus receptores

Download autodock

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 1,494.0 kB1884 kB [list of files]
amd64 1,468.0 kB1820 kB [list of files]
arm 1,479.0 kB1816 kB [list of files]
armel 1,475.5 kB1812 kB [list of files]
hppa 1,496.3 kB1848 kB [list of files]
hurd-i386 1,450.8 kB1788 kB [list of files]
i386 1,449.7 kB1733 kB [list of files]
ia64 1,570.5 kB2228 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 1,466.1 kB1836 kB [list of files]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 1,450.8 kB1804 kB [list of files]
m68k 1,438.1 kB1780 kB [list of files]
mips 1,501.0 kB1952 kB [list of files]
mipsel 1,499.5 kB1964 kB [list of files]
powerpc 1,476.0 kB1820 kB [list of files]
s390 1,460.7 kB1792 kB [list of files]
sparc 1,470.4 kB1832 kB [list of files]