Package: sra-toolkit (2.1.7a-1)

[ Source: sra-sdk  ]

Narzędzia do Sequence Read Archive z NCBI

Narzędzia do odczytywania archiwum SRA, zazwyczaj poprzez konwersję poszczególnych przebiegów do niektórych powszechnie używanych formatów, takich jak fastq.

Narzędzia do tekstowych zrzutów: sra-dump i vdb-dump zostały zamieszczone w tym wydaniu jako pomoc w kontroli wizualnej. Jest prawdopodobne, że efektywne formatowanie ich danych wyjściowych zostanie zmienione w najbliższej przyszłości do bardziej restrykcyjnych i sformalizowanych reprezentacji. PROSIMY NIE POLEGAĆ NA FORMACIE WYJŚCIOWYM POSTRZEGANYM W TYM WYDANIU.

Informacje związane z opcją "help" zostaną ulepszone w wydaniach, które pojawią się w niedalekiej przyszłości, a opcje narzędzi zostaną znormalizowane w całym zestawie. Dodatkowa dokumentacja znajduje się również na stronie NCBI.

Opcje narzędzi mogą ulec zmianie w następnym wydaniu. W miarę możliwości opcje narzędzi z 1 wydania będą nadal obsługiwane, aby zachować możliwość funkcjonowania istniejących skryptów.

Other Packages Related to sra-toolkit

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Wbudowana biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386]

  Wbudowana biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libxml2 (>= 2.6.27)

  Biblioteka GNOME XML

• dep: sra-toolkit-libs0 (>= 2.1.7a)

  Libraries for the SRA Toolkit

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Download sra-toolkit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,318.4 kB	3,436.0 kB	[list of files]
i386	1,375.8 kB	3,550.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	1,320.1 kB	3,389.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	1,365.8 kB	3,498.0 kB	[list of files]