Package: tabix (0.2.6-1)

[ Source: tabix  ]

Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu

Tabix indeksuje pliki, w których kolejność współrzędnych jest wskazywana przez niektóre kolumny, takie jak: name (zwykle z nazwą chromosomu), start i stop. Plik z danymi wejściowymi powinien być posortowany pod kątem pozycji (genomów) oraz skompresowany przy użyciu programu bgzip (dostarczonego w tym pakiecie), oferującego interfejs podobny do gzip. Po wykonaniu operacji indeksowania, Tabix może szybko wyszukiwać linie danych według współrzędnych chromosomalnych. Szybkie wyszukiwanie danych działa także za pośrednictwem sieci, jeśli URI jest podany jako nazwa pliku.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, network::client, Network Protocol: FTP, HTTP, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Compressing, Filtering, Works with: Text

Other Packages Related to tabix

• dep: libc6 (>= 2.7)

  Wbudowana biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Download tabix

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
s390	66.6 kB	163.0 kB	[list of files]