Pakiet: r-bioc-demixt (1.18.0+dfsg-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-demixt  ]

Cell type-specific deconvolution of heterogeneous tumor samples

When studying cancer cells from tumors excised from patients, the samples will be a mixture of tumors and healthy cells, e.g. from invading immune cells. For comparing samples, the interest may be more on comparing the transcriptome of the tumors themselves.

This package prepares the statistical separation (deconvolution) of RNAseq or microarray generated expression data for two or three components.

Inne pakiety związane z r-bioc-demixt

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nie alpha, ia64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie hppa, ia64, m68k, sh4]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie m68k, sh4, sparc64, x32]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4, sparc64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.13 [sh4, x32]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.15 [m68k, sparc64]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.17 [hppa, ia64]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.18 [nie hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.1.1-2) [sh4, x32]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

  dep: r-base-core (>= 4.2.0-1) [m68k, sparc64]

• dep: r-bioc-dss [nie m68k, sh4, sparc64, x32]

  Bioconductor dispersion shrinkage for sequencing data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-sva [nie m68k, sh4, sparc64, x32]

  GNU R Surrogate Variable Analysis

• dep: r-cran-base64enc

  GNU R package that provides tools for base64 encoding

• dep: r-cran-dendextend [nie m68k, sh4, sparc64, x32]

  Extending 'dendrogram' Functionality in GNU R

• dep: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-kernsmooth

  GNU R package for kernel smoothing and density estimation

• dep: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• dep: r-cran-matrixcalc

  GNU R functions for matrix calculations -- matrixcalc

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-psych [nie m68k, sh4, sparc64, x32]

  GNU R procedures for psychological, psychometric, and personality research

• dep: r-cran-rcpp (>= 1.0.0)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rmarkdown [nie sh4, x32]

  convert R markdown documents into a variety of formats

• dep: r-cran-truncdist

  GNU R functions for truncated random variables

• rec: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

Pobieranie r-bioc-demixt

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.18.0+dfsg-1	2 584,9 KiB	3 253,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.18.0+dfsg-1	2 601,1 KiB	3 144,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.18.0+dfsg-1	2 578,9 KiB	3 124,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.16.0+dfsg-1	2 591,9 KiB	3 192,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.16.0+dfsg-1	2 607,7 KiB	3 521,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.12.0+dfsg-1	2 501,0 KiB	3 006,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.18.0+dfsg-1	2 570,7 KiB	3 200,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.18.0+dfsg-1	2 588,0 KiB	3 256,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.18.0+dfsg-1	2 589,8 KiB	3 188,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.18.0+dfsg-1	2 593,9 KiB	3 064,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.18.0+dfsg-1	2 589,9 KiB	3 132,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.8.0-1	4 449,0 KiB	4 971,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.12.0+dfsg-1	2 486,0 KiB	3 005,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.8.0-1	4 439,5 KiB	4 944,0 KiB	[lista plików]