Pakiet: clustalw (2.1+lgpl-7)

[ Pakiet źródłowy: clustalw  ]

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Interaktywny interfejs tekstowy, Rola: role::program, scope::utility, Przeznaczenie: Porównywanie, Obsługa formatu: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Inne pakiety związane z clustalw

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• sug: clustalx

  Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: emboss

  European molecular biology open software suite

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie clustalw

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	275,1 KiB	787,0 KiB	[lista plików]
arm64	241,9 KiB	710,0 KiB	[lista plików]
armel	240,2 KiB	718,0 KiB	[lista plików]
armhf	249,6 KiB	542,0 KiB	[lista plików]
i386	294,8 KiB	834,0 KiB	[lista plików]
mips64el	259,1 KiB	941,0 KiB	[lista plików]
mipsel	258,4 KiB	912,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	276,5 KiB	918,0 KiB	[lista plików]
s390x	247,5 KiB	794,0 KiB	[lista plików]