[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Bron: primer3  ]

Pakket: primer3 (1.1.4-1)

Tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification

Primer3 picks primers for Polymerase Chain Reactions (PCRs), considering as criteria oligonucleotide melting temperature, size, GC content and primer-dimer possibilities, PCR product size, positional constraints within the source sequence, and miscellaneous other constraints. All of these criteria are user-specifiable as constraints, and some are specifiable as terms in an objective function that characterizes an optimal primer pair.

It has been published in Rozen S and Skaletsky H, "Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers.", Methods Mol Biol. 2000;132:365-86.

The Whitehead Institute for Biomedical Research provides a web-based front end to Primer3.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Supports Format: Plain Text

Andere aan primer3 gerelateerde pakketten

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [niet alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc6.1-udeb
  • sug: ncbi-epcr
    Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites

primer3 downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform Pakketgrootte Geïnstalleerde grootte Bestanden
alpha 106,8 kB276 kB [overzicht]
amd64 98,0 kB244 kB [overzicht]
arm 99,9 kB240 kB [overzicht]
armel 105,9 kB256 kB [overzicht]
hppa 103,1 kB240 kB [overzicht]
hurd-i386 95,7 kB236 kB [overzicht]
i386 96,5 kB196 kB [overzicht]
ia64 137,7 kB420 kB [overzicht]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 101,7 kB212 kB [overzicht]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 97,1 kB198 kB [overzicht]
m68k 88,0 kB228 kB [overzicht]
mips 102,5 kB272 kB [overzicht]
mipsel 102,6 kB272 kB [overzicht]
powerpc 102,2 kB252 kB [overzicht]
s390 97,7 kB236 kB [overzicht]
sparc 97,8 kB248 kB [overzicht]