[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Bron: amap-align  ]

Pakket: amap-align (2.2-1)

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Supports Format: Plain Text

Andere aan amap-align gerelateerde pakketten

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [niet alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
    Ook een virtueel pakket geboden door: libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [niet arm, armel, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    GCC support bibliotheek
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    GCC support bibliotheek
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    GCC support bibliotheek
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
    De GNU stdc++ bibliotheek versie 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1-4) [niet armel, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Een bibliotheek om de aanroep-ketting van een programma te bepalen - runtime

amap-align downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform Pakketgrootte Geïnstalleerde grootte Bestanden
alpha 162,6 kB356 kB [overzicht]
amd64 135,6 kB324 kB [overzicht]
arm 143,5 kB273 kB [overzicht]
armel 130,7 kB304 kB [overzicht]
hppa 157,9 kB328 kB [overzicht]
hurd-i386 122,8 kB300 kB [overzicht]
i386 124,4 kB256 kB [overzicht]
ia64 222,6 kB568 kB [overzicht]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 139,9 kB320 kB [overzicht]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 121,7 kB288 kB [overzicht]
m68k 112,3 kB296 kB [overzicht]
mips 155,7 kB384 kB [overzicht]
mipsel 156,4 kB384 kB [overzicht]
powerpc 149,5 kB316 kB [overzicht]
s390 125,1 kB304 kB [overzicht]
sparc 131,5 kB316 kB [overzicht]