パッケージ: sibsim4 (0.20-1)

[ ソース: sibsim4  ]

DNA テンプレート上で expressed RNA 配列を整列

SIBsim4 プロジェクトは sim4 に基づいています。sim4 は express RNA を 遺伝子配列と整列するために設計されたプログラムであり、イントロンも可能です。 SIBsim4 はオリジナルのコードをかなり大規模に書き直したものであり、次の目標が あります。

 * 速度の改善;
 * 大規模な染色体レベルの大きさの DNA 配列の利用を可能とする;
 * スプライン型に関するより詳細な情報を提供する;
 * polyA sites に関するより詳細な情報を提供する;
 * 雑多なコードの整理と修正。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::TODO, use::comparing, 検索, サポート形式: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の sibsim4 関連パッケージ

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

sibsim4 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	34.0 kB	108.0 kB	[ファイル一覧]
armel	34.0 kB	104.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	30.2 kB	79.0 kB	[ファイル一覧]
i386	32.1 kB	96.0 kB	[ファイル一覧]
ia64	49.6 kB	156.0 kB	[ファイル一覧]
kfreebsd-amd64	34.0 kB	82.0 kB	[ファイル一覧]
kfreebsd-i386	32.0 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]
mips	35.2 kB	116.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	35.5 kB	112.0 kB	[ファイル一覧]
powerpc	34.5 kB	108.0 kB	[ファイル一覧]
s390	34.6 kB	108.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	37.0 kB	104.0 kB	[ファイル一覧]
sparc	32.2 kB	104.0 kB	[ファイル一覧]