パッケージ: poa (2.0+20060928-3)

[ ソース: poa  ]

Partial Order Alignment for multiple sequence alignment

POA is Partial Order Alignment, a fast program for multiple sequence alignment (MSA) in bioinformatics. Its advantages are speed, scalability, sensitivity, and the superior ability to handle branching / indels in the alignment. Partial order alignment is an approach to MSA, which can be combined with existing methods such as progressive alignment. POA optimally aligns a pair of MSAs and which therefore can be applied directly to progressive alignment methods such as CLUSTAL. For large alignments, Progressive POA is 10-30 times faster than CLUSTALW.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の poa 関連パッケージ

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• sug: blast2

  基本的なローカル配列検索ツール

poa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	49.7 kB	164.0 kB	[ファイル一覧]
armel	52.6 kB	176.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	47.8 kB	155.0 kB	[ファイル一覧]
i386	46.5 kB	155.0 kB	[ファイル一覧]
ia64	72.6 kB	293.0 kB	[ファイル一覧]
kfreebsd-amd64	49.7 kB	125.0 kB	[ファイル一覧]
kfreebsd-i386	46.5 kB	116.0 kB	[ファイル一覧]
mips	44.9 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	45.2 kB	186.0 kB	[ファイル一覧]
powerpc	47.6 kB	180.0 kB	[ファイル一覧]
s390	51.4 kB	171.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	57.3 kB	196.0 kB	[ファイル一覧]
sparc	45.3 kB	179.0 kB	[ファイル一覧]