パッケージ: gromacs (4.5.5-1)

[ ソース: gromacs  ]

構築と解析ツールを含む分子動力学シミュレータ

GROMACS は分子動力学、つまり、数百から数百万の粒子からなるシステムについて ニュートンの運動方程式のシミュレーションを行う、多目的なパッケージです。

主に、たくさんの複雑に結合した相互作用を持つタンパク質や脂質のような生化学 分子のために設計されています。とはいえ、GROMACS は非結合性の相互作用 (通常 はそれがシミュレーションの大半を占める) の計算が極端に速いため、多くのグ ループは、たとえば高分子化合物のような、生物学以外のシステムに対する研究に も使用しています。

GROMACS は、短い記述では公正に説明できないほど、全体的に非常に多くの機能を 持っています。より完全な機能一覧表は <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/> から入手できます。

タグ: 分野: 生物学, 構造生物学, field::chemistry, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, interface::x11, role::program, インタフェースツールキット: X ライブラリ, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の gromacs 関連パッケージ

• dep: gromacs-data (= 4.5.5-1)

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libfftw3-3

  Library for computing Fast Fourier Transforms

• dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libx11-6

  X11 クライアントサイドライブラリ

• dep: libxml2 (>= 2.7.4)

  GNOME XML ライブラリ

• rec: cpp

  GNU C プリプロセッサ (cpp)

gromacs のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	5,789.4 kB	14,388.0 kB	[ファイル一覧]
armel	5,792.0 kB	12,600.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	6,801.3 kB	11,737.0 kB	[ファイル一覧]
i386	5,419.6 kB	13,384.0 kB	[ファイル一覧]
ia64	8,525.8 kB	25,808.0 kB	[ファイル一覧]
kfreebsd-amd64	5,764.6 kB	14,084.0 kB	[ファイル一覧]
kfreebsd-i386	5,368.1 kB	13,416.0 kB	[ファイル一覧]
mips	5,457.6 kB	12,488.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	5,466.0 kB	12,484.0 kB	[ファイル一覧]
powerpc	5,456.2 kB	11,416.0 kB	[ファイル一覧]
s390	5,432.3 kB	11,640.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	8,133.8 kB	17,810.0 kB	[ファイル一覧]
sparc	5,440.1 kB	11,280.0 kB	[ファイル一覧]