[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ ソース: openbabel  ]

パッケージ: openbabel (2.2.3-1 など)

Chemical toolbox utilities

Open Babel is a chemical toolbox designed to speak the many languages of chemical data. It allows to search, convert, analyze, or store data from molecular modeling, chemistry, solid-state materials, biochemistry, or related areas. Features include: 

 * Hydrogen addition and deletion
 * Support for Molecular Mechanics
 * Support for SMARTS molecular matching syntax
 * Automatic feature perception (rings, bonds, hybridization, aromaticity)
 * Flexible atom typer and perception of multiple bonds from atomic coordinates
 * Gasteiger-Marsili partial charge calculation

File formats Open Babel supports include PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC and MPQC.

This package includes the following utilities: 

 * babel: Convert between various chemical file formats
 * obenergy: Calculate the energy for a molecule
 * obminimize: Optimize the geometry, minimize the energy for a molecule
 * obgrep: Molecular search program using SMARTS pattern
 * obprop: Print standard molecular properties
 * obfit: Superimpose two molecules based on a pattern
 * obrotamer: Generate conformer/rotamer coordinates
 * obchiral: Print molecular chirality information
 * obrotate: Rotate dihedral angle of molecules in batch mode

タグ: 分野: 化学, 実装言語: C++, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: データの変換

その他の openbabel 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips, mipsel]
    dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [armel, hppa 以外]
    GCC 共有ライブラリ
    dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    GCC 共有ライブラリ
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [armel 以外]
    GNU 標準 C++ ライブラリ v3
    dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    圧縮ライブラリ - ランタイム

openbabel のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 2.2.3-1 122.7 kB480 kB [ファイル一覧]
armel 2.2.3-1+b1 111.5 kB420 kB [ファイル一覧]
hppa 2.2.3-1 124.1 kB444 kB [ファイル一覧]
i386 2.2.3-1 118.1 kB428 kB [ファイル一覧]
ia64 2.2.3-1+b1 146.3 kB604 kB [ファイル一覧]
mips 2.2.3-1 117.5 kB464 kB [ファイル一覧]
mipsel 2.2.3-1 117.1 kB464 kB [ファイル一覧]
powerpc 2.2.3-1 138.1 kB508 kB [ファイル一覧]
s390 2.2.3-1 119.0 kB432 kB [ファイル一覧]
sparc 2.2.3-1 118.8 kB428 kB [ファイル一覧]