Package: blast2 (1:2.2.21.20090809-2)

[ Source: ncbi-tools6  ]

基本的なローカル配列検索ツール

有名な連鎖配列 (sequence alignment) プログラムです。"公式な" NCBI バー ジョン #2 です。blastall の実行ファイルを使えば、 ヌクレオチドや蛋白質の配列をプログラムに与えることができます。 指定した配列を各種データベースと比較し、 マッチしたものの一覧をユーザに返します。

データベースは Debian に含まれていないことに注意してください。別途自分 で入手する必要があります。

Tags: Biology: biology::format:fasta, Nucleic Acids, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Science: Calculation, Scope: Utility, Purpose: Searching, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to blast2

• dep: libc6 (>= 2.7)

  組込用 GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libncbi6 (<< 6.1.20090809.1)

  NCBI libraries for biology applications

  dep: libncbi6 (>= 6.1.20090809)

• sug: libvibrant6a

  NCBI libraries for graphic biology applications

• sug: ncbi-rrna-data

  large rRNA BLAST databases distributed with the NCBI toolkit

• sug: ncbi-tools-bin

  生物学アプリケーション用 NCBI ライブラリ (テキスト版ユーティリティ)

• sug: ncbi-tools-x11

  生物学アプリケーション用 NCBI ライブラリ (Xベースユーティリティ)

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips	629.5 kB	1,340.0 kB	[list of files]