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パッケージ: gromacs (4.0.7-3)

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構築と解析ツールを含む分子動力学シミュレータ

GROMACS は分子動力学、つまり、数百から数百万の粒子からなるシステムについて ニュートンの運動方程式のシミュレーションを行う、多目的なパッケージです。

主に、たくさんの複雑に結合した相互作用を持つタンパク質や脂質のような生化学 分子のために設計されています。とはいえ、GROMACS は非結合性の相互作用 (通常 はそれがシミュレーションの大半を占める) の計算が極端に速いため、多くのグ ループは、たとえば高分子化合物のような、生物学以外のシステムに対する研究に も使用しています。

GROMACS は、短い記述では公正に説明できないほど、全体的に非常に多くの機能を 持っています。より完全な機能一覧表は <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/> から入手できます。

タグ: 分野: 生物学, 構造生物学, 化学, 実装言語: C, ユーザインタフェース: コマンドライン, X ウィンドウシステム, 役割: プログラム, インタフェースツールキット: X ライブラリ, X ウィンドウシステム: アプリケーション

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