パッケージ: topp (2.6.0+cleaned1-4 など)

[ ソース: openms  ]

set of programs implementing The OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) is a pipeline for the analysis of HPLC/MS data. It consists of a set of numerous small applications that can be chained together to create analysis pipelines tailored for a specific problem. The applications make use of the libopenms library. Some examples of these applications are :

  - TOPPView: A viewer for mass spectrometry data.
  - TOPPAS: An assistant for GUI-driven TOPP workflow design.
  - DTAExtractor: Extracts spectra of an MS run file to several
    files in DTA format.
  - FileConverter:  Converts between different MS file formats.
  - FileFilter: Extracts or manipulates portions of data from peak,
    feature or consensus feature files.
  - SpectraMerger: Merges spectra from an LC/MS map, either by
    precursor or by RT blocks.
  - BaselineFilter: Removes the baseline from profile spectra using a
    top-hat filter.
  - InternalCalibration: Applies an internal calibration.
  - PTModel: Trains a model for the prediction of proteotypic
    peptides from a training set.
  - RTPredict: Predicts retention times for peptides using a model
    trained by RTModel.
  - ExecutePipeline: Executes workflows created by TOPPAS.

タグ: インタフェースツールキット: Qt

その他の topp 関連パッケージ

• dep: coinor-libcbc3.1 (>= 2.10.11+ds1) [sparc64]

  Coin-or branch-and-cut 混合整数計画問題ソルバ（共有ライブラリ）

• dep: coinor-libcgl1 (>= 0.60.8+ds) [sparc64]

  COIN-OR Cut 生成ライブラリ

• dep: coinor-libclp1 (>= 1.17.9+ds) [sparc64]

  Coin-or 線形計画問題ソルバ（共有ライブラリ）

• dep: coinor-libcoinutils3v5 (>= 2.11.4+repack1) [sparc64]

  COIN-OR collection of utility classes (shared libraries)

• dep: coinor-libosi1v5 (>= 0.108.9+ds) [sparc64]

  COIN-OR Open Solver Interface

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Boost.Iostreams ライブラリ

• dep: libboost-math1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Boost.Math Library

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [alpha, m68k, x32]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.74.0

• dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.83.0

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [sparc64]

  使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sparc64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libglpk40 (>= 4.65) [sparc64]

  linear programming kit with integer (MIP) support

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libhdf5-103-1t64 [sparc64]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-cpp-103-1t64 (>= 1.10.5) [sparc64]

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b3) [m68k]

  library for LC/MS data management and analysis - runtime

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b5) [alpha]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4) [hppa, ia64, x32]

  dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-4+b2) [alpha, hppa, ia64, m68k, x32 以外]

• dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [alpha, hppa, ia64, m68k]

  Qt 5 コアモジュール

  dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [x32]

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.11.3) [arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64]

  Qt 5 コアモジュール

  dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1) [amd64, i386]

• dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3) [alpha, hppa, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 GUI モジュール

  または libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.11.3) [alpha, hppa, ia64, m68k, x32 以外]

  Qt 5 GUI モジュール

  または libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5network5t64 (>= 5.11.3) [sparc64]

  Qt 5 ネットワークモジュール

• dep: libqt5svg5 (>= 5.11.3) [sparc64]

  Qt 5 SVG モジュール

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3) [alpha, hppa, ia64, m68k, x32]

  Qt 5 ウィジェットモジュール

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.11.3) [alpha, hppa, ia64, m68k, x32 以外]

  Qt 5 ウィジェットモジュール

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9) [sparc64]

  SQLite 3 共有ライブラリ

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  Secure Sockets Layer ツールキット - 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k 以外]

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libsz2 (>= 1.1.3) [sparc64]

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: libwildmagic5 (>= 5.17) [sparc64]

  libraries for mathematics, physics, numerical methods - runtime

• dep: libxerces-c3.2 [alpha, hppa, ia64, m68k, x32]

  validating XML parser library for C++

• dep: libxerces-c3.2t64 [alpha, hppa, ia64, m68k, x32 以外]

  validating XML parser library for C++

• dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3) [alpha, m68k]

  package for LC/MS data management and analysis - shared data

  dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-4) [alpha, m68k 以外]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• sug: openms-doc

  package for LC/MS data management and analysis - documentation

topp のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-3+b5	2,978.8 kB	22,869.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,112.9 kB	17,628.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.6.0+cleaned1-4+b2	2,732.6 kB	20,932.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4	3,070.1 kB	17,182.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,287.9 kB	16,997.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4	3,752.2 kB	29,894.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-3+b3	3,171.2 kB	17,072.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.6.0+cleaned1-4+b2	2,730.4 kB	23,327.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,118.1 kB	25,800.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,078.7 kB	24,069.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,083.5 kB	14,316.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,072.6 kB	17,560.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4+b2	3,340.0 kB	184,771.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.6.0+cleaned1-4	3,027.2 kB	15,324.0 kB	[ファイル一覧]