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[ ソース: sibsim4  ]

パッケージ: sibsim4 (0.17-1)

DNA テンプレート上で expressed RNA 配列を整列

SIBsim4 プロジェクトは sim4 に基づいています。sim4 は express RNA を 遺伝子配列と整列するために設計されたプログラムであり、イントロンも可能です。 SIBsim4 はオリジナルのコードをかなり大規模に書き直したものであり、次の目標が あります。 

 * 速度の改善;
 * 大規模な染色体レベルの大きさの DNA 配列の利用を可能とする;
 * スプライン型に関するより詳細な情報を提供する;
 * polyA sites に関するより詳細な情報を提供する;
 * 雑多なコードの整理と修正。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: C, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: 比較, 検索, サポート形式: プレーンテキスト

その他の sibsim4 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k 以外]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

sibsim4 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
alpha 37.2 kB116 kB [ファイル一覧]
amd64 32.0 kB104 kB [ファイル一覧]
armel 32.9 kB104 kB [ファイル一覧]
avr32 (非公式の移植版) 34.0 kB92 kB [ファイル一覧]
hppa 33.6 kB104 kB [ファイル一覧]
hurd-i386 29.9 kB96 kB [ファイル一覧]
i386 30.4 kB96 kB [ファイル一覧]
ia64 47.3 kB152 kB [ファイル一覧]
kfreebsd-amd64 33.2 kB80 kB [ファイル一覧]
kfreebsd-i386 31.3 kB72 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 27.6 kB92 kB [ファイル一覧]
mips 34.2 kB112 kB [ファイル一覧]
mipsel 34.2 kB112 kB [ファイル一覧]
powerpc 33.9 kB108 kB [ファイル一覧]
s390 33.7 kB104 kB [ファイル一覧]
sparc 31.2 kB104 kB [ファイル一覧]