パッケージ: nast-ier (20101212+dfsg1-6 など)

[ ソース: microbiomeutil  ]

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

その他の nast-ier 関連パッケージ

• dep: cdbfasta

  Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, m68k, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: microbiomeutil-data

  Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

nast-ier のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	20.1 kB	147.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	20101212+dfsg1-6	19.9 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	20101212+dfsg1-6	19.6 kB	146.0 kB	[ファイル一覧]
armel	20101212+dfsg1-6	19.2 kB	94.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	20101212+dfsg1-6	19.0 kB	90.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	19.8 kB	94.0 kB	[ファイル一覧]
i386	20101212+dfsg1-6	20.0 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	21.4 kB	100.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-3	19.8 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	20101212+dfsg1-6	20.3 kB	148.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	20.8 kB	147.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	20101212+dfsg1-6	20.7 kB	147.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	20101212+dfsg1-6	19.8 kB	95.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	20101212+dfsg1-6	20.2 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	19.7 kB	146.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	19.5 kB	1,107.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	20101212+dfsg1-6	19.6 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]