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MUMmer は完全な形式又はドラフトの形式かどうかにかかわらず、遺伝子全体を高速に アライメントするためのシステムです。例えば、MUMmer 3.0 は 2.4 GHz CPU を搭載した Linux デスクトップコンピュータ上で 78 MB のメモリを使って 5 メガバイトの ゲノムの対から 20 basepair 又はより長い完全マッチングを全て 13.7 秒で発見できます。 MUMmer は不完全なゲノムもアライメントできます; shotgun アライメントプロジェクト 由来の 100 個又は 1000 個の contig を簡単に処理でき、それらを他の contig や システムに含まれる NUCmer プログラムを使った遺伝子にアライメントできます。 種が DNA 配置アライメントには分散しすぎて類似性を見つけられない場合、PROmer プログラムは両者の入力配列の 6 フレーム変換に基づき配列を生成できます。
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| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| alpha | 420.8 kB | 1312 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 392.3 kB | 1156 kB | [ファイル一覧] |
| arm | 395.0 kB | 1088 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 366.9 kB | 1048 kB | [ファイル一覧] |
| hppa | 433.3 kB | 1168 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 370.1 kB | 972 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 | 566.0 kB | 1856 kB | [ファイル一覧] |
| kfreebsd-amd64 (非公式の移植版) | 392.9 kB | 1054 kB | [ファイル一覧] |
| kfreebsd-i386 (非公式の移植版) | 374.0 kB | 970 kB | [ファイル一覧] |
| m68k | 352.3 kB | 1048 kB | [ファイル一覧] |
| mips | 408.4 kB | 1300 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 409.9 kB | 1292 kB | [ファイル一覧] |
| powerpc | 420.8 kB | 1184 kB | [ファイル一覧] |
| s390 | 379.7 kB | 1084 kB | [ファイル一覧] |
| sparc | 378.0 kB | 1108 kB | [ファイル一覧] |