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[ ソース: gromacs  ]

パッケージ: gromacs (4.0.5-4 など)

Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools

GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.

It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.

GROMACS offers entirely too many features for a brief description to do it justice. A more complete listing is available at <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

タグ: 分野: 生物学, 構造生物学, 化学, 実装言語: C, ユーザインタフェース: コマンドライン, X ウィンドウシステム, 役割: プログラム, インタフェースツールキット: X ライブラリ, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の gromacs 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: gromacs-data (= 4.0.4-1) [m68k]
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
    dep: gromacs-data (= 4.0.5-4) [m68k 以外]
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    X11 Inter-Client Exchange library
  • dep: libsm6
    X11 Session Management library
  • dep: libx11-6
    X11 client-side library
  • rec: cpp
    GNU C プリプロセッサ (cpp)

gromacs のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
alpha 4.0.5-4 4,599.9 kB16480 kB [ファイル一覧]
amd64 4.0.5-4 4,379.3 kB15608 kB [ファイル一覧]
armel 4.0.5-4 4,775.8 kB17096 kB [ファイル一覧]
hppa 4.0.5-4 4,311.2 kB17676 kB [ファイル一覧]
i386 4.0.5-4 3,731.5 kB12556 kB [ファイル一覧]
ia64 4.0.5-4 6,250.3 kB35332 kB [ファイル一覧]
kfreebsd-amd64 4.0.5-4 4,378.6 kB15544 kB [ファイル一覧]
kfreebsd-i386 4.0.5-4 3,727.1 kB12640 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 4.0.4-1 3,808.6 kB12524 kB [ファイル一覧]
mips 4.0.5-4 4,204.3 kB20460 kB [ファイル一覧]
mipsel 4.0.5-4 4,166.1 kB20460 kB [ファイル一覧]
powerpc 4.0.5-4 4,391.7 kB18336 kB [ファイル一覧]
s390 4.0.5-4 4,337.4 kB14540 kB [ファイル一覧]
sparc 4.0.5-4 4,027.2 kB16292 kB [ファイル一覧]