Package: sibsim4 (0.20-1)

[ Source: sibsim4  ]

allinea sequenze RNA espresse su un modello DNA

Il progetto SIBsim4 si basa su sim4, che è un programma progettato per allineare una sequenza DNA espressa con una sequenza genomica, permettendo la presenza di introni. SIBsim4 è una riscrittura piuttosto estesa del codice originale con in mente i seguenti obiettivi:

 * miglioramento della velocità;
 * possibilità di usare grandi, dell'ordine di cromosomi, sequenze di
   DNA;
 * output più dettagliato sui tipi di splicing;
 * output più dettagliato sui siti polyA;
 * varie correzioni e ripuliture del codice.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to sibsim4

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

Download sibsim4

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	34.0 kB	108.0 kB	[list of files]
armel	34.0 kB	104.0 kB	[list of files]
armhf	30.2 kB	79.0 kB	[list of files]
i386	32.1 kB	96.0 kB	[list of files]
ia64	49.6 kB	156.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	34.0 kB	82.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	32.0 kB	74.0 kB	[list of files]
mips	35.2 kB	116.0 kB	[list of files]
mipsel	35.5 kB	112.0 kB	[list of files]
powerpc	34.5 kB	108.0 kB	[list of files]
s390	34.6 kB	108.0 kB	[list of files]
s390x	37.0 kB	104.0 kB	[list of files]
sparc	32.2 kB	104.0 kB	[list of files]