Package: poa (2.0+20060928-3)

[ Source: poa  ]

Partial Order Alignment per allineamenti multipli di sequenza

POA è Partial Order Alignment, un programma veloce per MSA (allineamenti multipli di sequenza) in campo bioinformatico. I suoi vantaggi sono velocità, scalabilità, sensibilità e una capacità superiore di gestire ramificazioni e inserzioni/delezioni nell'allineamento. POA è un approccio a MSA che può essere combinato con metodi esistenti come l'allineamento progressivo. POA allinea in maniera ottimale una coppia di MSA e ciò può essere successivamente applicato direttamente a metodi di allineamento progressivo come CLUSTAL. Per allineamenti grandi, Progressive POA è 10-30 volte più veloce di CLUSTALW.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to poa

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• sug: blast2

  Basic Local Alignment Search Tool

Download poa

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	49.7 kB	164.0 kB	[list of files]
armel	52.6 kB	176.0 kB	[list of files]
armhf	47.8 kB	155.0 kB	[list of files]
i386	46.5 kB	155.0 kB	[list of files]
ia64	72.6 kB	293.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	49.7 kB	125.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	46.5 kB	116.0 kB	[list of files]
mips	44.9 kB	186.0 kB	[list of files]
mipsel	45.2 kB	186.0 kB	[list of files]
powerpc	47.6 kB	180.0 kB	[list of files]
s390	51.4 kB	171.0 kB	[list of files]
s390x	57.3 kB	196.0 kB	[list of files]
sparc	45.3 kB	179.0 kB	[list of files]