Package: boxshade (3.3.1-6)

[ Source: boxshade  ]

belle stampe di allineamenti multisequenza

Boxshade è un programma per creare stampe di bell'aspetto a partire da sequenze proteiche o di DNA multi-allineate. Il programma non fa il reale allineamento e necessita di un file input creato da un programma per allineamenti multipli o creato a mano con strumenti adatti.

Boxshade legge sequenze multiallineate da file PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save, (limitatamente ad un massimo di 150 sequenze con fino a 10.000 elementi ciascuna). Vari tipi di ombreggiatura possono essere applicati a residui identici/simili. L'output è scritto a schermo o in un file nei seguenti formati: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, biology::peptidic, field::biology, Field: Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• sug: kalign

  allineamenti multipli di sequenza globali e progressivi

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  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

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• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX supplementary packages

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  strumento per generazione interattiva di figure in X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	52.1 kB	165.0 kB	[list of files]
armel	53.4 kB	163.0 kB	[list of files]
armhf	47.7 kB	147.0 kB	[list of files]
i386	48.8 kB	160.0 kB	[list of files]
ia64	68.2 kB	258.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	52.3 kB	119.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	48.6 kB	114.0 kB	[list of files]
mips	48.6 kB	176.0 kB	[list of files]
mipsel	49.1 kB	176.0 kB	[list of files]
powerpc	50.7 kB	167.0 kB	[list of files]
s390	53.8 kB	171.0 kB	[list of files]
s390x	55.8 kB	179.0 kB	[list of files]
sparc	49.1 kB	163.0 kB	[list of files]