Package: ssake (3.8-2)

[ Source: ssake  ]

applicazione genomica per assemblare milioni di cortissime sequenze di DNA

SSAKE (Short Sequence Assembly by K-mer search and 3′ read Extension, assemblaggio di sequenze corte con ricerca di K-meri ed estensione per lettura 3') è un'applicazione genomica per assemblare in modo aggressivo milioni di corte sequenze di nucleotidi cercando progressivamente k-meri all'estremità 3' perfetti usando un albero di prefissi di DNA. SSAKE è progettato per aiutare a sfruttare le informazioni provenienti dalla lettura di corte sequenze riunendole in maniera stringente in frammenti continui che possono essere usati per caratterizzare innovativi target di sequenziamento.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, Implemented in: implemented-in::perl, implemented-in::python, User Interface: Command Shell, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Analysing

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• dep: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

• dep: python

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