Package: sibsim4 (0.17-1)

allinea sequenze RNA espresse su un modello DNA

Il progetto SIBsim4 si basa su sim4, che è un programma progettato per allineare una sequenza DNA espressa con una sequenza genomica, permettendo la presenza di introni. SIBsim4 è una riscrittura piuttosto estesa del codice originale con in mente i seguenti obiettivi:

 * miglioramento della velocità;
 * possibilità di usare grandi, dell'ordine di cromosomi, sequenze di
   DNA;
 * output più dettagliato sui tipi di splicing;
 * output più dettagliato sui siti polyA;
 * varie correzioni e ripuliture del codice.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Searching, Supports Format: Plain Text