Package: tree-puzzle (5.2-5)

[ Source: tree-puzzle  ]

ricostruzione di alberi filogenetici con il metodo della massima verosimiglianza

TREE-PUZZLE (nuovo nome di PUZZLE) è un programma interattivo per console che implementa un veloce algoritmo di ricerca di alberi chiamato "quartet puzzling" che permette l'analisi di grandi insiemi di dati e che assegna automaticamente stime di verosimiglianza per ciascun ramo interno. TREE-PUZZLE calcola anche la massima distanza verosimile per coppie di elementi, nonché la lunghezza di rami per alberi specificati dall'utente. Le lunghezze dei rami possono anche essere calcolate in base all'ipotesi dell'orologio molecolare. In aggiunta, TREE-PUZZLE offre un metodo nuovo, la mappatura di verosimiglianza, per studiare la verosimiglianza di un ramo interno ipotizzato senza calcolare un albero totale e per visualizzare il contenuto filogenetico di un allineamento di sequenze.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to tree-puzzle

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
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• dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, i386, mips, mipsel]

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  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

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• dep: libsprng2

  The SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  ricostruzione di alberi filogenetici con il metodo della massima verosimiglianza

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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armel	153.0 kB	368.0 kB	[list of files]
i386	126.1 kB	324.0 kB	[list of files]
ia64	212.0 kB	668.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	142.6 kB	322.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	125.5 kB	306.0 kB	[list of files]
mips	163.2 kB	444.0 kB	[list of files]
mipsel	162.6 kB	444.0 kB	[list of files]
powerpc	151.3 kB	364.0 kB	[list of files]
s390	139.9 kB	336.0 kB	[list of files]
sparc	137.6 kB	340.0 kB	[list of files]