allineamenti multipli di sequenze probabilistici basati sulla coerenza
Strumento per generare allineamenti multipli di sequenze proteiche che usa
una combinazione di modelli probabilistici e di tecniche di allineamento
basate sulla coerenza. PROBCONS ha ottenuto dei livelli di accuratezza più
alti di tutti i metodi di allineamento usati fino ad oggi. Nei test con il
database degli allineamenti di riferimento BAliBASE, gli allineamenti
prodotti con PROBCONS mostrano un significativo miglioramento rispetto ai
programmi attuali poiché contengono in media il 7% in più di colonne
correttamente allineate rispetto a T-Coffee, l'11% in più rispetto a
CLUSTAL W ed il 14% in più rispetto a DIALIGN. PROBCONS è stato pubblicato
in Do, C.B., Mahabhashyam, M.S.P., Brudno, M., and Batzoglou, S.
2005. Genome Research 15: 330-340.
