Package: exonerate (2.2.0-2)
Links for exonerate
Debian Resources:
Download Source Package exonerate:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.ebi.ac.uk]
Similar packages:
strumento generico per il confronto di sequenze di coppie
Exonerate permette l'allineamento di sequenze tramite molti modelli di allineamento, usando una programmazione dinamica esaustiva o una varietà di euristiche. Molte delle funzionalità della suite di programmazione dinamica Wise sono state reimplementate in C per una migliore efficienza. Exonerate è un componente intrinseco della struttura dei database genomici Ensembl, che fornisce punteggi di somiglianza tra sequenze di RNA e di DNA e così determinando varianti di splicing e sequenze di codifica generali.
Un sistema di simulazione per esperimenti PCR In-silico (vedere la pagina man di ipcress) è fornito con exonerate.
Questo pacchetto contiene una selezione di utilità per effettuare velocemente semplici manipolazioni su file fasta oltre i 2 Gb.
Other Packages Related to exonerate
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- dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
- libreria C GNU embedded: librerie condivise
also a virtual package provided by libc0.1-udeb
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- dep: libc6 (>= 2.3) [amd64]
- libreria C GNU embedded: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, mips, mipsel, powerpc, s390]
- dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
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- dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
- libreria C GNU embedded: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.12.0)
- libreria GLib di routine in C
-
- sug: wise
- confronto tra biopolimeri, tipicamente DNA e sequenze proteiche
Download exonerate
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 3,243.7 kB | 8,952.0 kB | [list of files] |
| armel | 3,504.7 kB | 9,128.0 kB | [list of files] |
| i386 | 3,096.7 kB | 8,468.0 kB | [list of files] |
| ia64 | 4,899.9 kB | 20,384.0 kB | [list of files] |
| kfreebsd-amd64 | 3,242.6 kB | 8,828.0 kB | [list of files] |
| kfreebsd-i386 | 3,088.3 kB | 8,312.0 kB | [list of files] |
| mips | 3,470.8 kB | 10,620.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 3,459.9 kB | 10,624.0 kB | [list of files] |
| powerpc | 3,140.3 kB | 8,944.0 kB | [list of files] |
| s390 | 3,401.8 kB | 8,836.0 kB | [list of files] |
| sparc | 2,987.4 kB | 8,592.0 kB | [list of files] |