Package: boxshade (3.3.1-4)

[ Source: boxshade  ]

belle stampe di allineamenti multisequenza

Boxshade è un programma per creare stampe di bell'aspetto a partire da sequenze proteiche o di DNA multi-allineate. Il programma non fa il reale allineamento e necessita di un file input creato da un programma per allineamenti multipli o creato a mano con strumenti adatti.

Boxshade legge sequenze multiallineate da file PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save, (limitatamente ad un massimo di 150 sequenze con fino a 10.000 elementi ciascuna). Vari tipi di ombreggiatura possono essere applicati a residui identici/simili. L'output è scritto a schermo o in un file nei seguenti formati: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, Proteins, Software Development: Prettyprint, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Typesetting, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Plain Text, PostScript, TeX and LaTeX

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [ia64]

  libreria C GNU embedded: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• sug: kalign

  allineamenti multipli di sequenza globali e progressivi

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• sug: xfig

  strumento per generazione interattiva di figure in X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	51.8 kB	244.0 kB	[list of files]
armel	52.7 kB	244.0 kB	[list of files]
i386	45.8 kB	172.0 kB	[list of files]
ia64	66.7 kB	336.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	51.8 kB	170.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	45.3 kB	158.0 kB	[list of files]
mips	52.3 kB	280.0 kB	[list of files]
mipsel	52.4 kB	280.0 kB	[list of files]
powerpc	51.1 kB	248.0 kB	[list of files]
s390	53.0 kB	248.0 kB	[list of files]
sparc	49.2 kB	240.0 kB	[list of files]